Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCKBRP32239 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms