Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5AP29375 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms