Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms