Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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