Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB3P14651 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms