Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CDH1P12830 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms