Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms