Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEFHP12036 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEFHP12036 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEFHP12036 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEFHP12036 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEFHP12036 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEFHP12036 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEFHP12036 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEFHP12036 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEFHP12036 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEFHP12036 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEFHP12036 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEFHP12036 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEFHP12036 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEFHP12036 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEFHP12036 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEFHP12036 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEFHP12036 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEFHP12036 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEFHP12036 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEFHP12036 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEFHP12036 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms