Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C8orf89P0DMQ9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms