Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPR89BP0CG08 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms