Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
JRKO75564 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JRKO75564 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JRKO75564 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JRKO75564 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JRKO75564 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JRKO75564 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JRKO75564 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JRKO75564 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JRKO75564 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JRKO75564 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JRKO75564 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JRKO75564 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms