Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIN3BO75182 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms