Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNJ2O15056 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms