Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EBAG9O00559 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBAG9O00559 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms