Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM1B2RUZ4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
SMIM1B2RUZ4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms