Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWA8A3KMH1 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms