Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC162PA2VCL2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC162PA2VCL2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms