Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG4BQ9Y4P1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms