Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS4AQ9UN37 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms