Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms