Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBE1Q9UJT0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms