Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG3Q9UJ98 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STAG3Q9UJ98 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms