Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PPARGC1AQ9UBK2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PPARGC1AQ9UBK2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms