Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
XCL2Q9UBD3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms