Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D2Q9NY47 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms