Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCM2LQ9NUG4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms