Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHST11Q9NPF2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms