Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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LIN28AQ9H9Z2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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LIN28AQ9H9Z2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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LIN28AQ9H9Z2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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LIN28AQ9H9Z2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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LIN28AQ9H9Z2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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LIN28AQ9H9Z2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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