Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00597Q9H2U6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00597Q9H2U6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00597Q9H2U6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00597Q9H2U6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00597Q9H2U6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00597Q9H2U6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00597Q9H2U6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00597Q9H2U6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms