Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL4Q9C0H6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms