Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms