Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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KRTAP1-5Q9BYS1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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KRTAP1-5Q9BYS1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP1-5Q9BYS1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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