Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TUBB2BQ9BVA1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms