Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIN3AQ96ST3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms