Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCT8L2Q96SF2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms