Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
LINC00208Q96KT6 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
LINC00208Q96KT6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms