Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PHF21BQ96EK2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms