Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ULK4Q96C45 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms