Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF3C6Q969F1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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GTF3C6Q969F1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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GTF3C6Q969F1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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GTF3C6Q969F1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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GTF3C6Q969F1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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GTF3C6Q969F1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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GTF3C6Q969F1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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GTF3C6Q969F1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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