Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHMTQ93088 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms