Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms