Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC38A9Q8NBW4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC38A9Q8NBW4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms