Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms