Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC174Q6PII3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms