Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms