Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WASHC2DQ5SRD0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms