Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCTE1Q5JU00 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms