Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF2Q5BJF6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms