Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms