Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTXN3Q4LDR2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTXN3Q4LDR2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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